Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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USP34Q70CQ2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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USP34Q70CQ2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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USP34Q70CQ2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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USP34Q70CQ2 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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USP34Q70CQ2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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USP34Q70CQ2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
USP34Q70CQ2 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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