Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms