Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN2P49810 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSEN2P49810 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms