Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms