Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPB2P35606 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPB2P35606 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPB2P35606 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPB2P35606 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms