Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMA5P28066 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMA5P28066 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms