Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYN1P17600 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYN1P17600 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYN1P17600 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYN1P17600 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYN1P17600 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYN1P17600 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SYN1P17600 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SYN1P17600 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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