Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCN2BO60939 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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