Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms