Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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