Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TBCCD1Q9NVR7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms