Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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