Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms