Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PRAC1Q96KF2 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC098679.3-201ENST00000512016 3115 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CDRT1-204ENST00000395906 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC007342.6-201ENST00000624289 2594 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MR1-201ENST00000282990 2043 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PROM2-202ENST00000317668 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 EFNB2-201ENST00000245323 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 HOPX-205ENST00000420433 1543 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 HOXA-AS3-202ENST00000518947 3992 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LILRB1-206ENST00000396332 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CMKLR1-201ENST00000312143 5283 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PHACTR3-203ENST00000361300 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TMEM108-202ENST00000393130 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TTC12-210ENST00000483239 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 EHMT1-240ENST00000637318 2983 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 BTBD18-201ENST00000422652 3044 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 RFC5-201ENST00000392542 2449 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CAPN9-202ENST00000354537 2484 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ENO4-203ENST00000409522 1840 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 CCDC40-203ENST00000374877 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 EXD2-201ENST00000312994 5107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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PRAC1Q96KF2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PRKCA-AS1-203ENST00000584715 2113 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 AL451074.2-201ENST00000423121 2150 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 SEMA4D-207ENST00000420987 4275 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PRAC1Q96KF2 ALAS1-205ENST00000484952 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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