Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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