Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC4Q5GLZ8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms