Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RFTN2Q52LD8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms