Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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