Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms