Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
POLR2KP53803 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms