Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ARID4AP29374 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms