Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms