Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT13P13646 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT13P13646 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KRT13P13646 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms