Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BCKDHAP12694 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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