Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms