Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUSC1Q9BVN2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms