Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TCF23Q7RTU1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms