Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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TLR1Q15399 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TLR1Q15399 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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