Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FRMPD4Q14CM0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms