Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP5P45974 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP5P45974 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP5P45974 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms