Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLBP1P12271 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms