Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CT47B1P0C2W7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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