Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GLI1P08151 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GLI1P08151 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GLI1P08151 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms