Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB3P05106 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB3P05106 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB3P05106 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB3P05106 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB3P05106 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGB3P05106 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB3P05106 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB3P05106 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB3P05106 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms