Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC6Q9UBN7 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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