Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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USP35Q9P2H5 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP35Q9P2H5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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