Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms