Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SPOCK3Q9BQ16 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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