Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO3Q8TAP4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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