Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRIM48Q8IWZ4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRIM48Q8IWZ4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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