Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CFAP100Q494V2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms