Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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