Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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CUL3Q13618 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CUL3Q13618 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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