Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.125-201ENST00000618659 283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSEN1P49768 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSEN1P49768 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms