Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPOP42166 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMPOP42166 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms