Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPB2P35606 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms