Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYT1P21579 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms