Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM21P19474 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms