Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA4P13612 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms