Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMG5Q9UPR3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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